Investigation of phenotypic and genotypic characteristics of isolated Vibrio anguillarum strains in rainbow trout cage farms in Kahramanmaraş city of Turkey


Published: Jan 20, 2023
Keywords:
Oncorhynchus mykiss Phenotypic Genotypic Vibrio anguillarum BIOLOG GEN III PCR Sequence.
M Özcan
https://orcid.org/0000-0001-9032-0697
E Donat
Abstract
Bu çalışma, Kahramanmaraş, Türkiye bölgesindeki kafes çiftliklerinde kültürlenen gökkuşağı alabalığındaki Vibrio anguillarum suşlarının fenotipik ve genotipik özelliklerinin izolasyonu ve incelenmesi ile ilgilidir . Bu amaç için, karaciğer, dalak, böbrek ve bağırsak örnekleri fenotipik özelliklerini ve biyokimyasal kimlik incelemek üzere Haziran 2014 farklı kafes çiftliklerinde yaklaşık 250-300 g ağırlığında alabalık farklı gökkuşağı alınmıştır V. anguillarum , Biolog Sistemi, gökkuşağı alabalığından alınan örneklerden elde edilen saf vibrio suşlarına uygulandı. 20 V. anguillarumu doğrulamak için spesifik bir primer ile polimeraz zincir reaksiyon tekniği kullanıldıfenotipik ve biyokimyasal özelliklere göre belirlenen suşlar. Daha sonra, bunların hepsinin V. anguillarum olduğu doğrulandı . Örneklerden elde edilen V. anguillarum suşlarının sekans analizi gerçekleştirildi ve daha sonra bunların karşılık gelen verileri yorumlandı. Bu çalışmanın sonucunda V. anguillarum bakterileri iki farklı alabalık kafesi çiftliğinde tespit edilmiştir. V. anguillarum'un tanımlanma süresi kültür yöntemi ile üç hafta sürerken , kısa sürede PCR tekniği ile yapıldı. 
Article Details
  • Section
  • Research Articles
Downloads
Download data is not yet available.
References
Actis LA, Tolmasky ME, Crosa JH (2011) Vibriosis. In: Fish Diseases and Disorders, Volume 3. CABI, 2nd edition, 570-605 pp.
Akan M, Yıldız H, İzgür M, Atay D (1996) Levreklerde Vibrio anguillarum’a bağlı vibriozis olgusu. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 2: 40-43.
Akaylı T 2001 Kültür Çipura balıklarında (Sparus aurata, L.1758) Vibriosis’in Elisa ve bakteriyolojik yöntemlerle teşhisi. İstanbul Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü. Doktora Tezi, İstanbul 77 pp.
Akaylı T, Ürkü Ç, Çanak Ö (2013) Kültür gökkuşağı alabalıklar (Oncorhynchus mykiss, Walbaum 1792)’ından izole edilen gram-negatif bakterilerin antibiyotik duyarlılığı. Biyoloji Bilimleri Araştırma Dergisi, 6 (2), 11-15.
Akşit D, Kum C (2008) Gökkuşağı Alabalıkları (Oncorhynchus mykiss, Walbaum 1792)’nda sık görülen patojen mikroorganizmaların tespiti ve antibiyotik duyarlılık düzeylerinin belirlenmesi. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 19(1), 1-7.
Arda M, Seçer S, Sarıeyyüpoğlu S (2005) Balık Hastalıkları. Medisan Yayın Serisi:61 Ankara 230 pp.
Austin B, Austin DA (2007) Bacterial Fish Pathogens: Disease in Farmed and Wild Fish 4th edition. Springer-Praxis publishing, Chichester, UK 594 pp.
Austin B, Pride AC, Rhodie GA (2003) Association of a bacteriophage with virulence in Vibrio harveyi. Journal Fish Diseases, 26 (1), 55-58.
Biosca EG, Oliver JD, Amaro C (1996) Phenotypic characterization of Vibrio vulnificus biotype 2, a lipopolysaccharide-based homogeneous O serogroup within Vibrio vulnificus. Applied and Environmental Microbiology 62 (3), 918-927.
Borrego JJ, Castro D, Luque A, Paillard C, Maes P, Garcia MT, Ventosa A (1996) Vibrio tapetis sp nov, the causative agent of the brown ring disease affecting cultured clams. International Journal Of Systematic Bacteriology, 46(2), 480-484.
Candan A (1993) Vibrio anguillarum infection in Sparus aurata L. 1758. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 23: 25-27.
Candan A (2000) Türkiyede üretilen Atlantik Salmon (Salmo salar L.)’unda saptanan ilk vibriosis olgusu. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 30: 107-108
Çağırgan H (1993) Kültürü Yapılan Çipura (Sparus aurata, L) ve levrek (Dicentrarchus labrax L.) balıklarında görülen bakteriyel hastalıkların teşhis ve tedavisi üzerine bir araştırma. Ege Üniv. Fen Bilimleri Enstitüsü Su Ürünleri Anabilim Dalı Doktora Tezi, İzmir 117 pp.
Çağırgan, H. (2004) Levrek yavrularında (Dicentrarchus labrax L., 1758) vibriozise karşı aşı gelişirilmesi. Ege Üniversitesi Su Ürünleri Dergisi, 21, 271-274.
Demircan D, Candan A (2006) Idendification of Vibrio anguillarum by PCR (rpoN Gene) associated with Vibriosis in Marine Fish in Turkey. Turkish Journal of Veterinary and Animal Sciences, 30: 305-310.
Eguchi M, Fujiwara E, Miyamoto N (2000) Survival of Vibrio anguillarum in freshwater environments: adaptation or debilitation? Journal of Infection and Chemotherapy 6, 126-129.
Frans I, Michiels CW, Bossier P, Willems KA, Lievens B, Rediers H (2011) Vibrio anguillarum as a Fish Pathogen: Virulence Factors, Diagnosis and Prevention. Journal of Fish Diseases 34 (9), 643-61.
Hjeltnes B, Roberts RJ (1993) Vibriosis, In Bacterial Diseases of Fish, pp. 109-121. Edited by Inglis V, Roberts RJ, Bromage NR. Oxford: Blackwell Scientific.
Korun J, Timur G (2008) Marine Vibriosis associated with diseased sea bass (Dicentrachus labrax) in Turkey. Journal of FisheriesSciences.com (online), 2 (1), 66-76.
Lin CK, Tsen HY (1996) Use of two 16S DNA Targeted oligonücleotides as PZR primers for the specific detection of Salmonella in foods. Journal of Applied Bacteriology, 80: 659–666.
Noga EJ (2000) Fish Diseases: Diagnosis and Treatment. Iowa State University Press, Ames. 367 pp.
Peggy AR, Francus-Floyd R (2002) Vibrio Infections of Fish.http://edis.ifas.ufl.edu. Erişim Tarihi: 01.06. 2002.
Reed PA, Francis-Floyd R (2013) Vibrio infections of fish. http://ufdcimages.uflib.ufl.edu/IR/00/00/13/26/00001/FA03600.pdf, Son Erişim Tarihi: 10.01.2013.
Schiewe MH, Trust TJ, Crosa JH (1981) Vibrio ordalii sp. nov.: A Causative Agent of Vibriosis in Fish. Current Microbiology, 6, 343-348.
Tanrıkul TT (2007) Vibriosis as an epizootik disease of Rainbow Trout (Onchorynchus mykiss) in Turkey. Pakistan Journal of Biological Sciences, 10 (10), 1733-1737.
Tanrıkul TT, Çağırgan H, Tokşen E (2004) Levrek’lerden (Dicentrarchus labrax L., 1758) izole edilen Vibrio türlerinin API 20E yöntemiyle identifikasyonu. Ege Üniversitesi Su Ürünleri Dergisi, 21(3-4), 243– 247.
Timur G, Korun J (2004) First outbreak of Vibriosis in farmed Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss) in Turkey. Istanbul University Journal of Fisheries, 18, 1-9.
Toranzo AE, Barja JL (1990) A review of the taxonomy and seroepizootiology of Vibrio anguillarum, with special reference to aquaculture in the nortwest of Spain. Diseases of Aquatic Organism, 9, 73-82.
Woo PTK, Bruno DW (2003) Fish Disease Disorders, Volume 3: Viral, bacterial and fungal infections. CABI Publishing Oxfordshire, UK.
Xiao P, Mo ZL, Mao YX, Wang CL, Zou YX (2009) Detection of Vibrio anguillarum by PCR Amplification of the empA Gene. Journal of Fish Diseases, 32: 293–296.