Whole genome sequencing of vancomycin resistant Enterococcus faecium isolated from cat and dog
Περίληψη
Vancomycin-resistant enterococci (VRE) have emerged as a significant increasingly become an public health concern over past few decades due to their association with serious multidrug-resistant (MDR) infections. This study utilized whole genome sequencing (WGS) to perform molecular characterization of three VRE isolates previously recovered from two cats and one dog. The genomic DNA of the isolates was extracted and sequencing was performed using the Illumina Novaseq platform. The genomes of Enterococcus faecium HMKU_VREfm_Dog12, Enterococcus faecium HMKU_VREfm_Cat95 and Enterococcus faecium HMKU_VREfm_Cat103 consisted of 2707111 bp, 2715129 bp, and 2664256 bp, respectively with GC content of 37.95%, 38.03% and 38.01%, respectively. Multidrug antimicrobial resistance genes conferring resistance to aminoglycosides (aac(6’)-aph(2’) and ant(6)-Ia), lincosamides (lnu(B) and lsa(E)), macrolides (erm(A), erm(B), msr(A), msr(C), and msr(B)), trimethoprim (dfrG) and tetracyclines (tet(L) and tet(M)) were identified. The sequence type (ST) of each isolate was determined using the Enterococcus PubMLST database. The isolates were found to belong to different STs (ST2248 in VREfm_Dog12, ST43 in VREfm_Cat95, and ST284 in VREfm_Cat103). The isolates carried only efaAfm (adhesion-associated protein) as virulence gene. To the best of the authors’ knowledge, this study is the first to provide insights into genetic diversity of VREfm strains isolated from dogs and cats using whole genome sequencing analysis in Turkey. The findings underscore the importance of genomic surveillance in monitoring the dissemination of MDR VREfm in pet animals.
Λεπτομέρειες άρθρου
- Πώς να δημιουργήσετε Αναφορές
-
Aslantaş, Ö, Televi, H., Büyükaltay, K., & Tek, E. (2025). Whole genome sequencing of vancomycin resistant Enterococcus faecium isolated from cat and dog. Περιοδικό της Ελληνικής Κτηνιατρικής Εταιρείας, 76(3), 9671–9680. https://doi.org/10.12681/jhvms.39639
- Τεύχος
- Τόμ. 76 Αρ. 3 (2025)
- Ενότητα
- Research Articles
Αυτή η εργασία είναι αδειοδοτημένη υπό το CC Αναφορά Δημιουργού – Μη Εμπορική Χρήση 4.0.
Οι συγγραφείς των άρθρων που δημοσιεύονται στο περιοδικό διατηρούν τα δικαιώματα πνευματικής ιδιοκτησίας επί των άρθρων τους, δίνοντας στο περιοδικό το δικαίωμα της πρώτης δημοσίευσης.
Άρθρα που δημοσιεύονται στο περιοδικό διατίθενται με άδεια Creative Commons 4.0 Non Commercial και σύμφωνα με την άδεια μπορούν να χρησιμοποιούνται ελεύθερα, με αναφορά στο/στη συγγραφέα και στην πρώτη δημοσίευση για μη κερδοσκοπικούς σκοπούς.
Οι συγγραφείς μπορούν να καταθέσουν το άρθρο σε ιδρυματικό ή άλλο αποθετήριο ή/και να το δημοσιεύσουν σε άλλη έκδοση, με υποχρεωτική την αναφορά πρώτης δημοσίευσης στο J Hellenic Vet Med Soc
Οι συγγραφείς ενθαρρύνονται να καταθέσουν σε αποθετήριο ή να δημοσιεύσουν την εργασία τους στο διαδίκτυο πριν ή κατά τη διαδικασία υποβολής και αξιολόγησής της.
