Πλαστικά και Βιοδιάσπαση: Μια μέτα-ανάλυση με το βλέμμα γύρω από τη Μεσόγειο


Ιουλία Σοκολάκη
Νίκος Νικολόπουλος
Καλλιόπη-Διονυσία Ρίζου
Ελένη Σιδηροπούλου
Μαρία Καπασά, Βιολόγος, Μsc, PhD Επιβλέπουσα εκπαιδευτικός
Βαμνιές Δημήτριος, Χημικός MSc -Τεχνολόγος Τροφίμων Επιβλέπων εκπαιδευτικός
Abstract

Η συσσώρευση πλαστικών αποτελεί έναν εκτεταμένο περιβαλλοντικό κίνδυνο. Μελέτες στοχεύουν στην ταυτοποίηση, απομόνωση και ανάλυση ουσιών που παράγονται από μικροοργανισμούς και μπορούν να αξιοποιηθούν στην βιοδιάσπαση των πλαστικών. Στην παρούσα εργασία συλλέχθηκαν δεδομένα από τις πιο πρόσφατες μελέτες του πεδίου και από δημοσιεύσεις ανασκόπησης που αφορούν σε βιοχημικά δεδομένα και στοιχεία δομικής βιολογίας των παραπάνω ενζύμων. Ακολούθησε βιοπληροφορική ανάλυση των αλληλουχιών τους και in silico ταυτοποίηση μικροοργανισμών που συνθέτουν πρωτεΐνες με παρόμοια λειτουργία. Τέλος αξιοποιήθηκαν τα δεδομένα εκτεταμένων μελετών χαρτογράφησης μικροβιωμάτων με στόχο την ανίχνευση μικροοργανισμών που να μπορούν να συμμετάσχουν στη βιοδιάσπαση πλαστικών στην ευρύτερη περιοχή της Μεσογείου.

Article Details
  • Section
  • Greece
Downloads
Download data is not yet available.
References
Bell, E.L., Smithson, R., Kilbride, S. et al. Directed evolution of an efficient and thermostable PET depolymerase. Nat Catal 5, 673–681 (2022).
Burgin, T., Pollard, B.C., Knott, B.C. et al. The reaction mechanism of the Ideonella sakaiensis PETase enzyme. Commun Chem 7, 65 (2024).
Han, X., Liu, W., Huang, JW. et al. Structural insight into catalytic mechanism of PET hydrolase. Nat Commun 8, 2106 (2017).
Moog, D., Schmitt, J., Senger, J. et al. Using a marine microalga as a chassis for polyethylene terephthalate (PET) degradation. Microb Cell Fact 18, 171 (2019).
Matias Rodrigues, J. F., Schmidt, T. S. B., Tackmann, J. & Von Mering, C. Bioinformatics 33, 3808–3810 (2017).
Protein Data Bank (PDB) https://www.rcsb.org/.
National Center for Biotechnology Information (NCBI) https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi.
Microbe atlas: https://microbeatlas.org/.