Serotypic diversity and sequence variation of the ompA gene among Mannheimia haemofytica isolates from domestic ruminants
Περίληψη
H Mannheìmia haemolytica αποτελεί ένα από τα σημαντικότερα αίτια πνευμονίας στα μηρυκαστικά. Εξαιτίας των σοβαρών οικονομικών επιπτώσεων που προκαλεί, διάφορες μέθοδοι έχουν χρησιμοποιηθεί με στόχο τη επιζωοτιολογική μελέτη και τη μελέτη της παθογένειας του βακτηρίου, Σκοπός της παρούσας έρευνας ήταν η διερεύνηση της συχνότητας απομόνωσης των διαφόρων οροτύπων της Mannheìmia haemolytica στην Ελλάδα και η γενετική ανάλυση ενός σημαντικού γονιδίου λοιμοτοξικότητας του βακτηρίου, του γονιδίου ompAt Για το σκοπό αυτό, μελετήθηκαν ενενήντα τέσσερα στελέχη Μ, haemolytica που απομονώθηκαν από τεμάχια πνευμονικού ιστού ενός βοοειδούς, προβάτων και αιγών με μακροσκοπικές αλλοιώσεις πνευμονίας. Η ταυτοποίηση των στελεχών έγινε με βασικές βιοχημικές δοκιμές, καθώς και με τη μέθοδο της Πολλαπλής Αλυσιδωτής Αντίδρασης της Πολυμεράσης (Multiplex PCR), 11 οροτυποποίηση των στελεχών έγινε με τη μέθοδο της έμμεσης αιμοσυγκόλλησης. Για την μελέτη των πολυμορφισμών τ ου γονιδίου ompA, χρησιμοποιήθηκαν δύο μέθοδοι: η μέθοδος της Ιΐλ^κτροφόρησης Ιΐηκτής με ΔιαβαΟμισμένη Λποδιατακτική Σύσταση (ÜGGH-Dcnaturing Gradient Gel Blectrophoresis) και η ανάλυση της αλληλουχίας του γονιδίου (DNA sequencing). Ανάμεσα στα ενενήντα τέσσερα στελέχη, βρέθηκαν οι ορύτυποι Α15 Α2, Α5, Α6, Α7, Α9 και Α12. Ο ορότυπος Α2 ήταν ο επικρατέστερος. Το μοναδικό στέλεχος που απομονώθηκαν από βοοειδές ήταν Α2, όπως και τα στελέχη από αίγες. Τα υπόλοιπα στελέχη Α2 προήλθαν από πρόβατα. Η ανάπτυξη και εφαρμογή της μεθόδου DGGE αποκάλυψε πέντε διαφορετικά πρότυπα μεταξύ των στελεχών. Τα στελέχη πρόβειας προέλευσης, εμφάνισαν μεγαλύτερη παραλλακτικότητα (τέσσερα διαφορετικά πρότυπα), από αυτά που προέρχονταν από αίγες (δύο διαφορετικά πρότυπα). Το πρότυπο 2 ήταν το πιο διαδεδομένο και ακολουθούσαν τα πρότυπα Ι και 3, Το σύνολο των στελεχών που απομονώθηκαν από αίγες ανήκε σε δύο από αυτά τα πρότυπα, Η μέθοδος της ανάλυσης των αλληλουχιών του DNA εφαρμόστηκε με στόχο την επιβεβαίωση των αποτελεσμάτων της DGGE και την εύρεση των συγκεκριμένων πολυμορφισμών. Η μελέτη του γονιδίου ompA ανέδειξε 11 διαφορετικούς γονότυπους μεταξύ των στελεχών της Μ, haemolytica, που χωρίστηκαν σε εννέα συνολικά ομάδες, Τα στελέχη των προβάτων έδειξαν μεγαλύτερη ετερογένεια
και κατατάχθηκαν σε οκτώ ομάδες, δύο από τις οποίες ήταν οι πολυπληθέστερες. Η πλειοψηφία των στελεχών που απομονώθηκαν από αίγες ανήκε στην ομάδα IX, η οποία συνέπιπτε με το πρότυπο 1 της DGGE. Η μελέτη της δευτεροταγούς δομής της πρωτεΐνης OmpA εντόπισε τις αντικαταστάσεις αμινοξέων στους επιφανειακούς βρόχους της πρωτεΐνης και, πιο συγκεκριμένα, στις υπερμεταβλητές περιοχές. Καθώς, για πρώτη φορά διεθνώς, αναφέρονται πολυμορφισμοί του γονιδίου ompA στελεχών της Μ. haemolytica τα οποία έχουν απομονωθεί από αίγες, τα στοιχεία της έρευνας συμβάλλουν στη μελέτη της εξελικτικής πορείας του γονιδίου, και στην αποσαφήνιση της ύπαρξης ή μη ειδικότητας των διαφόρων υπο-ομάδων ως προς τον ξενιστή.
Λεπτομέρειες άρθρου
- Πώς να δημιουργήσετε Αναφορές
-
VOUGIDOU (Χ. ΒΟΥΓΙΔΟΥ) C., SANDALAKIS (Β. ΣΑΝΤΑΛΑΚΗΣ) V., PSAROULAKI (Α. ΨΑΡΟΥΛΑΚΗ) A., PETRIDOU (Ε.Ι. ΠΕΤΡΙΔΟΥ) E., DONACHIE, W., & EKATERINIADOU (Λ.ΑΙΚΑΤΕΡΙΝΙΑΔΟΥ) L. (2017). Serotypic diversity and sequence variation of the ompA gene among Mannheimia haemofytica isolates from domestic ruminants. Περιοδικό της Ελληνικής Κτηνιατρικής Εταιρείας, 63(1), 13–24. https://doi.org/10.12681/jhvms.15389
- Τεύχος
- Τόμ. 63 Αρ. 1 (2012)
- Ενότητα
- Research Articles
Οι συγγραφείς των άρθρων που δημοσιεύονται στο περιοδικό διατηρούν τα δικαιώματα πνευματικής ιδιοκτησίας επί των άρθρων τους, δίνοντας στο περιοδικό το δικαίωμα της πρώτης δημοσίευσης.
Άρθρα που δημοσιεύονται στο περιοδικό διατίθενται με άδεια Creative Commons 4.0 Non Commercial και σύμφωνα με την άδεια μπορούν να χρησιμοποιούνται ελεύθερα, με αναφορά στο/στη συγγραφέα και στην πρώτη δημοσίευση για μη κερδοσκοπικούς σκοπούς.
Οι συγγραφείς μπορούν να καταθέσουν το άρθρο σε ιδρυματικό ή άλλο αποθετήριο ή/και να το δημοσιεύσουν σε άλλη έκδοση, με υποχρεωτική την αναφορά πρώτης δημοσίευσης στο J Hellenic Vet Med Soc
Οι συγγραφείς ενθαρρύνονται να καταθέσουν σε αποθετήριο ή να δημοσιεύσουν την εργασία τους στο διαδίκτυο πριν ή κατά τη διαδικασία υποβολής και αξιολόγησής της.