Απομόνωση και μοριακός χαρακτηρισμός του γενώματος του ίου Noda σε λαβράκια (Dicentrarchus labrax L.)> που εκτρέφονται σε γλυκό και θαλασσινό νερό στην Ελλάδα

PDF (English)
Δημοσιευμένα: Nov 29, 2017
DOI: https://doi.org/10.12681/jhvms.15074
Λέξεις-κλειδιά:
Dicentrarchus labrax ιός Noda απομόνωση μοριακός χαρακτηρισμός του γενώματος του ίου
E. XYLOURI (Ε. ΞΥΛΟΥΡΗ)
Εργαστήριο Ανατομίας & Φυσιολογίας Αγροτικών Ζώων, Τμήμα Ζωικής Παραγωγής, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών
J. KOTZAMANIS (Ι. ΚΟΤΖΑΜΑΝΗΣ)
Institut für Physiologische Chemie und Pathobiochemie, Abteilung Angewandte Molekularbiologie Johannes Gutenberg-Universität.; Εργαστήριο Διατροφής και Παθολογίας Ιχθύων, Ινστιτούτο Υδατοκαλλιεργειών, Ελληνικό Κέντρο Θαλασσίων Ερευνών
F. ATHANASSOPOULOU (ΑΘΑΝΑΣΟΠΟΥΛΟΥ Φ.)
Εργαστήριο Ιχθυολογίας-Ιχθυοπαθολογίας, Τμήμα Κτηνιατρικής, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας
L. DONG
Εργαστήριο Ανατομίας & Φυσιολογίας Αγροτικών Ζώων, Τμήμα Ζωικής Παραγωγής, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών
A. ARGYROKASTRITIS (ΑΛ. ΑΡΓΥΡΟΚΑΣΤΡΙΤΗΣ)
Εργ. Γενικής & Ειδικής Ζωοτεχνίας, Τμήμα Ζωικής Παραγωγής, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών
E. FRAGKIADAKI (ΕΙΡ. ΦΡΑΓΚΙΑΔΑΚΗ)
Εργαστήριο Ανατομίας & Φυσιολογίας Αγροτικών Ζώων, Τμήμα Ζωικής Παραγωγής, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών
Περίληψη

Σκοπός της παρούσας μελέτης ήταν η απομόνωση του ίου Noda από ιχθυες γλυκού νερού και ειδικά από το είδος Dicentrarchus labrax L. (λαβράκι) και ο μοριακός χαρακτηρισμός του. Σε προηγούμενες μελέτες έχει αναφερθεί η ανίχνευση τουίου Noda με τη μέθοδο της Αλυσιδωτής Αντίδρασης της Πολυμεράσης (ΑΑΠ) σε λαβράκια (Dicentrarchus labrax) που εμφάνιζαν κλινικά συμπτώματα και εκτρέφονταν υπό εντατικές συνθήκες σε γλυκό νερό. Δεν είχε, όμως, επιτευχθεί η απομόνωση του σε κυτταροκαλλιέργεια. Η παρούσα μελέτη περιγράφει την απομόνωση του ίου Noda από ελληνικές εκτροφές λαβρακιου που εμφάνιζαν κλινικά συμπτώματα και που εκτρέφονταν τόσο σε θαλάσσιο όσο και σε γλυκό νερό. Ο ιός απομονώθηκε στην ειδική συνεχή κυτταρική σειρά SSN-1, εκδηλώνοντας χαρακτηριστικό κυτταροπαθογόνο αποτέλεσμα υπό μορφή κενοτοποίωσης και εκφύλισης. Παράλληλα, στο σύνολο των δειγμάτων εγκεφαλικού ιστού και οφθαλμών που προέρχονταν από μολυσμένα λαβράκια, ανιχνεύθηκε, με χρήση της Ανάστροφης Μεταγραφής - της Αλυσιδωτής Αντίδρασης Πολυμεράσης (Reverse Transcription-PCR) και με την τεχνική της nestedRT-PCR (nested Reverse Transcription) - PCR, ένθετη ανάστροφης αντιγραφής- PCR, μια γενωμική περιοχή μεγέθους 255 ζευγών βάσεων (ζβ). Η σύγκριση της αλληλουχίας των νουκλεοτιδίων της παραπάνω περιοχής με αντίστοιχη που ανιχνεύθηκεσε ασθενή λαβράκια ευρωπαϊκής εκτροφής και σε άλλα είδηιχθύων ανέδειξε μεγάλο βαθμό ομολογίας μεταξύ τους.

Λεπτομέρειες άρθρου
  • Ενότητα
  • Research Articles

Οι συγγραφείς των άρθρων που δημοσιεύονται στο περιοδικό διατηρούν τα δικαιώματα πνευματικής ιδιοκτησίας επί των άρθρων τους, δίνοντας στο περιοδικό το δικαίωμα της πρώτης δημοσίευσης.

Άρθρα που δημοσιεύονται στο περιοδικό διατίθενται με άδεια Creative Commons 4.0 Non Commercial και σύμφωνα με την άδεια μπορούν να χρησιμοποιούνται ελεύθερα, με αναφορά στο/στη συγγραφέα και στην πρώτη δημοσίευση για μη κερδοσκοπικούς σκοπούς.

Οι συγγραφείς μπορούν να καταθέσουν το άρθρο σε ιδρυματικό ή άλλο αποθετήριο ή/και να το δημοσιεύσουν σε άλλη έκδοση, με υποχρεωτική την αναφορά πρώτης δημοσίευσης στο J Hellenic Vet Med Soc

Οι συγγραφείς ενθαρρύνονται να καταθέσουν σε αποθετήριο ή να δημοσιεύσουν την εργασία τους στο διαδίκτυο πριν ή κατά τη διαδικασία υποβολής και αξιολόγησής της.

Λήψεις
Τα δεδομένα λήψης δεν είναι ακόμη διαθέσιμα.
Αναφορές
Altschul S.F., Gish W., Miller W., Myers E.W. and Lipman D. J., 1990. Basic local alignment search tool. Journal of Molecular Biology 215, 403-410.
Athanassopoulou F., 1990. A study of the Myxosporean infections of R. rutilus L. with special reference to Myxidium rhodei Leger, 1905 in the renal tissue. Ph.D. Thesis, University of Stirling.
Athanassopoulou F., Billinis C, Prapas Th., 2004. Important disease conditions of new cultured species (Acipenser. gueldestaedi, Mugil sp., Dicentrarchus labrax and Silurus sp., Oreochromis sp.) in intensive freshwater farming conditions in Greece: First incidence of Noda virus infection in Acipenser sp. Diseases of Aquatic Organisms, 60, 241-246.
Athanassopoulou F., Billinis C, Psychas V., Karipoglou K., 2003. Viral encephalopathy and retinopathy of Dicentrarchus labrax L. farmed in freshwater in Greece. Journal of Fish Diseases 26,361-365
Bovo G., Nishizawa T., Maltese C, Borghesan F., Multinelli F., Montesi F, De Mas S., 1999. Viral encephalopathy and retinopathy of farmed marine fish species in Italy. Virus Research 631, 43-146.
Breuil G., Mouchel O., Fauvel C, Pepin JF. 2001. Sea bass Dicentrarchus labrax nervous necrosis virus isolates with distinct pathogenicity to sea bass larvae. Diseases of Aquatic Organisms 45 (1),
-31.
Castri J., Thiery R., Jeffroy J., de Kinkelin P., Raymond J.C, 2001. Sea bream Sparus aurata, an asymptomatic contagious fish host for noda virus. Diseases of Aquatic Organisms 47 (1), 33-38.
Comps M., Pepin J.F., Bonami J.R., 1994. Purification and characterization of two fish encephalitis viruses (FEV) infecting Lates calcarifer and Dicentrarchus labrax. Aquaculture, 123, 1-10.
Dalla Valle L., Negrisolo E., Patarnello P., Zanella L., Maltese C, Bovo G., Colombo L. 2001. Sequence comparison and phylogenetic analysis of fish nodaviruses based on the coat protein gene. Archives of Virology 146, 1125-1137.
Dendrinos P., Thorpe P., 1985. Effects of reduced salinity on growth and body composition in the European bass D. labrax. Aquaculture 49, 333-358.
Drury R.A., Wallington E.A. (Eds) 1980. Carleton's histological Techniques, 5th Edition Oxford University Press, Oxford. 520pp.
Fotis G., 1999. Fish Pathology and Aquaculture. Vol. I. Current education editions, Thessaloniki. 382pp.
Frerichs G. N., Tweedie Α., Starkey W. G.,. Richards R. H., 2000. Temperature, pH and electrolyte sensitiviy and heat, Uvand disinfectant inacivation of sea bass D. labrax neuropathy nodavirus. Aquaculture 185,13-24.
Hedge Α., The HC, Lam TJ., Sin YN. (2003). Nodavirus infection in freshwater ornamental fish, guppy, Poicelia reticulatacomparative characterization and pathogenicity studies. Arch Virol. 10, 1007-1019.
Iwamoto T., Mori K., Arimoto M. Nakai T., 1999. High permissivity of the fish cell line SSN-1 for piscine nodaviruses. Diseases of Aquatic Organisms 39 (1), 37-47.
Jalil J., D. Gomez, T. Nakai, I. Sharifpour, C. Shau-Chi, M. Soltani, M. Sharif, Rohani and A. Saidi. (2004): Virology, molecular biology and histopathology investigations on mortality of wild
golden grey mullet (Liza-auratus) in Iranian waters of Caspian Sea. In press.
Kaesbergh P., 1987. In: Rowlands D.J., Mayo M.A., Mahy B.W.J. (Eds.), Molecular Biology of Positive Strand RNA Virus, Academic Press, London, 207-218.
Le Breton et al., 1996 Α., Grisez L., Sweetman J., Ollevier F., 1996. Viral nervous necrosis (VNN) associated with mass mortality in cage reared sea bass (Dicentrarchus labrax). J. Fish Dis. 20,145-Ï5L
Mori K., Nakai T., Muroga K., Arimito M., Mushiake K., Furusawa I., (1992). Properties of a new virus belonging to nodaviridae found in larval striped jack Pseudocaranx dentex with nervous necrosis. Virology 187, 368-371.
Munday BL., Kwang J. & Moody, N., 2002. Betanodavirus infections of teleost fish: a review. Journal of Fish Diseases 25,127-142.
Nagai T., Nishizawa T., 1999. Sequence of the non-structural protein gene encoded by RNA 1 of striped jack nervous necrosis virus. J. Gen. Virol. 80, 3019-302Σ
Nishizawa T., Mori K., Nakai T., Muroga K., 1994. Polymerase chain reaction (PCR) amplification of RNA of striped jack nervous necrosis virus (SJNNV). Diseases of Aquatic Organisms 18,103-107.
RobertsRJ., 1989. Fish Pathology. Bailliere- Tindall. London. 467pp
Roberts R.J., Shepherd C.J., 1997. Handbook of trout and salmon diseases. Fishing News Books, Oxford. 179pp.
Sambrook J., Frisch E.F., Maniatis T., 1989. Molecular cloning. In: A Laboratory Manual, Second Ed. Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY.
Skliris G.P., Krondiris J.V., Sideris D.C., Shinn A.P., Starkley W.G.. Richards R.H., 2001. Phylogenetic and antigenic characterization of new fish nodavirus isolates from Europe and Asia. Virus Research 75 (1), 59-67.
Thiery R., Raymond J.C, Castri J., 1999a. Natural outbreak of viral encephalopathy and retinopathy in juvenile sea bass Dicentrarchus labrax: study by nested reverse transcriptasepolymerase chain reaction. Virus Research 63, 11-17.
Thiery R., Arnauld C, Delsert C. 1999ß. Two isolates of sea bass D. labrax, nervous necrosis virus with distinct genomes. J. Fish Dis. 22: 201-207.
Ucko M., Colorni Α., Diamant Α., 2004. Nodavirus infections from Israeli mariculture. Journal of Fish Diseases 27 (8), 459- 469.
Τα περισσότερο διαβασμένα άρθρα του ίδιου συγγραφέα(s)